博士克拉多进化？
首先，我要告诉题主，在口袋妖怪红宝石386中，没有传说中的“超级进化”！ 所谓的“超级进化”在口袋妖怪中只是玩家对某些宝可梦通过遗传、交易、收集等途径得到的特殊形态的称呼（比如说火鸡战士），但这些宝可梦在游戏中并没有在种族值上加以区别，因此这些特殊的形态实际上就是某只宝可梦的特定亚种而已。它们有的可能在能力上有细微的不同，但绝大多数的能力都很相近甚至完全一样。例如我拥有的火鸡战士们，能力都一样，只是因为外表不同而被我分别命名为A、B、C…… 另外需要提到的是，虽然口袋妖怪有单机和在线两个版本，但是它们的游戏机制是大体相同的，只有在部分游戏细节和个别宝可梦中有所差异。因此下面的讨论以单机版为蓝本。
那么现在讨论的问题就变成了「博士的宝可梦会不会进化」这个问题的答案其实很明确——会进行进化，但是进化的方向取决于游戏的进行方式。如果玩家们能够按照一般的游戏流程来玩的话，那么博士的宝可梦最终会进化成为不同的宝可梦；反之，如果玩家使用金手指或者作弊器，不让博士的宝可梦升级的话，那么无论故事进行到什么时候，他们的宝可梦都始终会是原始状态。
不过我还是要说明一点，因为口袋妖怪系列是以“游戏—动漫—手办“为产品模式的游戏厂商，所以尽管游戏的机制大致相同，但不同的游戏之间仍然会有一些细微的差异（比如一些技能的在搭配上的不同），因此我的结论只是在一般情况下的分析。